Mckoi DataBase:McKoiDB 是GPL 的license, 是由纯Java开的数据库。他的 JDBC Driver 是使用 JDBC version 3 的 Spec. 他也是遵循 SQL-92 的标准, 也尽量支持新的 SQL 特色, 并且支持 Transaction 的功能.

yaRDBMS:yaRDBMS (yet another relational database management system) 也是一个基于java的关系型数据库。支持事务，查询优化，灾难性恢复，索引支持。

Neo:Neo是一个图形数据库（graph database）。它是一个可嵌入，基于磁盘的Java持久化引擎，其数据存储采用图形结构来代替表格。一张graph就是一种网状的结构图更适合于敏捷、快速开发。特性：能够以直观，面向图形的方式展示数据，网状结构图由节点，关联和属性组成。Neo能够在单一计算机上处理几十亿个节点，关联和属性。一个强大的横向移动框架能够在节点空间中快速横向移动。整个Neo大小还不到500k。拥有简单、便利、面向对象的API。此外Neo包括一些数据库固有的特性：ACID事务支持，数据持久化, 并行控制, 事务恢复等。

SQLJet:SQLJet是一个采用纯Java实现的SQLite数据库。数据库格式与SQLite3.6相兼容。并提供API让Java程序可以创建、读取和修改SQLite数据库。

Berkeley DB JE:Berkeley DB JE是一个高性能的事务存储引擎完全利用Java开发.Berkeley DB JE在应用程序的地址空间(address space)上执行,不需要进行服务端与客户端的通讯.它应用程序的原生格式来存储格数据所以不需要在运时期进行数据的转换.Berkeley DB JE完全支持ACID事务与恢复.

hamsterdb-java:hamsterdb-java是hamsterdb嵌入式数据库的一个Java封装。hamsterdb是一个采用C开发，非常快，轻量级的嵌入式数据库引擎。

JODB:JODB是一个面向对象开源数据库。该数据库使用缓存机制来避免占用太多内存。在查询时也尽可能减少实例化对象以避免进行过多地垃圾收集。

Apache Xindice:Apache Xindice也是一个Native-XML数据库(NXD).Xindice 提供了命令行界面来管理数据库。Xindice使用XPath做为它的查询语言与XML:DB XUpdate做为它的更新语言.

SMYLE:SMYLE 一个基于 LGPL 的高可靠性、高性能 Java 数据库，能够处理 100,000 行的表，支持多维索引、事务处理、崩溃及时恢复等特性。SMYLE 可以嵌入到应用中，不需要单独安装发布。

Ozone:ozone是一个面向对象的数据库管理系统完全用Java实现.ozone项目的目的是让开发者可以构建一个纯面向对象,纯Java的数据库应用程序.ozone还可以用来存储XML,可以用任XML工具来访问这些数据.