NeoDatis ODB:NeoDatis ODB是一个面向对象数据库，一个真正透明的对象持久层。利用一行简单的代码就能够持久化native object。ODB非常简单、非常快并自带强大查询语言。ODB既可以做为一个内嵌数据库引擎使用，也可以以C/S模式运行。

JavuSQL:JavuSQL（原先叫SimpleSQL）是一个非常小关系型数据库。包括JDBC驱动只有200kB左右，数据存储在一个64-bit的文件中。SQL语法支持SQL-92标准。

FeatherDB:FeatherDB是一个采用Java开发基于JSON的Document数据库，是CouchDB的一个克隆。它拥有一个完整的HTTP/REST接口，支持通过Java类或JavaScript（使用java6的JavaScript支持）实现查询。FeatherDB使用嵌入的Jetty HTTP服务器来处理所有交互。

Metanotion BlockFile:BlockFile一个100%纯Java，轻量级，单个文件嵌入式数据库。它的功能介于SQLite与BerkeleyDB之间。专门为PDA和Mobile应用程序而开发。

Mckoi DataBase:McKoiDB 是GPL 的license, 是由纯Java开的数据库。他的 JDBC Driver 是使用 JDBC version 3 的 Spec. 他也是遵循 SQL-92 的标准, 也尽量支持新的 SQL 特色, 并且支持 Transaction 的功能.

SmallSQL:SmallSQL是一个100%纯Java的DBMS,一个用于Java桌面应用程序的嵌入式关系型数据库。它有一个JDBC3.0接口并提供许多ANSI SQL92和ANSI SQL99特性。SmallSQL非常小而且快速因为它没有网络接口。

HeliDB:HeliDB是一个简单、快速的数据库，用于存储来自Java程序的key—value成对数据。可以通过配置来使该数据库支持不同的功能和存储方式。最简单的配置情况下，该数据库只是一个基于文件的Map，更复杂的配置，该数据库将使用B+树数据结构来提供快速搜索、新增和事务支持。

Apache Derby:Apache Derby 是一种高质量的、纯 Java™ 的嵌入式关系数据库引擎，IBM® 最近已将其捐献给开放源码社区。Derby 数据库基于文件系统，具有高度的可移植性，并且是轻量级的，这使得它非常便于发布。

BaseX:BaseX是一个原生XML数据库。它具有简洁的存储结构，高效的XPath和XQuery实现和一个用于操作存储数据的可视化前台操作界面。

Neo:Neo是一个图形数据库（graph database）。它是一个可嵌入，基于磁盘的Java持久化引擎，其数据存储采用图形结构来代替表格。一张graph就是一种网状的结构图更适合于敏捷、快速开发。特性：能够以直观，面向图形的方式展示数据，网状结构图由节点，关联和属性组成。Neo能够在单一计算机上处理几十亿个节点，关联和属性。一个强大的横向移动框架能够在节点空间中快速横向移动。整个Neo大小还不到500k。拥有简单、便利、面向对象的API。此外Neo包括一些数据库固有的特性：ACID事务支持，数据持久化, 并行控制, 事务恢复等。